항문암은 항문 부위의 성병 혹은 만성 치루 등에서 발병하기도 합니다.
여성 환자의 경우 자궁경부암을 일으키는 human papilloma virus이 항문암을 동시에 일으키기도 합니다. 따라서 항문암으로 진단받은 여성 환자는 부인과 진찰도 받아야 합니다.
AIDS 환자가 발병률이 높으며 특히 항문성교를 하는 경우 바이러스에 간염 될 수 있습니다.